Cordula Fischer sammelte erste Erfahrungen als Chorsängerin im Jugendchor des Nürnberger Lehrergesangvereins.

Nach ihrem Abitur studierte sie Schulmusik, Stimmbildung und Chordirigieren an der Hochschule für Musik Franz Liszt Weimar. Bereits während ihres Studiums erhielt Cordula Fischer einen Lehrauftrag für die Kinderchorarbeit an der Hochschule für Musik Weimar und übernahm dazu den Philharmonischen Kinder-und Jugendchor Erfurt, der heute als Chorakademie Erfurt unter ihrer Leitung eng mit dem Theater Erfurt zusammenarbeitet. Zudem war sie als künstlerische Assistentin des Hochschul-Kammerchors tätig und leitete verschiedene Kinderchöre.

2002 gründete Cordula Fischer die schola cantorum weimar.